1999年冠军杯决赛中噩梦般的经历并没有击垮拜仁慕尼黑队。进入新千年以后，球队在卡恩、埃芬博格和埃尔博的率领下在各条战线上都取得了不错的成绩，开创了一个新的时代。传奇门将卡恩1999-2000赛季的欧洲冠军杯上，拜仁慕尼黑队小组赛中碰到了皇家马德里队。他们在伯纳乌和奥林匹克体育场分别以4比2和4比1的比分战胜对手。在半决赛中两队再次相遇，拜仁慕尼黑队这次却因为净胜球少而被挡在了决赛大门外。希斯菲尔德的球队又一次举起了冠军奖盘，但这个冠军却是意外之喜。他们要感谢最后一轮成功阻击勒沃库森队的温特哈兴，在比赛中巴拉克自摆乌龙。而在另一块场地上，拜仁慕尼黑队3比1拿下云达不来梅。这也成就了温特哈兴，大多中国球迷知道温特哈兴也是因为这次大逆转。在德国杯决赛上，拜仁慕尼黑队3比0完胜云达不来梅，报了去年决赛点球负于对手的一箭之仇。这也是球队历史上第三次夺得联赛杯赛双冠王。卡恩也被评为当年的德国足球先生。球迷对于2000-2001赛季的经历更是难忘。在德国杯第二轮，球队就被业余队马格德堡淘汰。但在联赛最后一轮，在比赛进行到90分钟却被对手汉堡队射手巴巴雷茨攻破球门，使得冠军就要旁落的不利情况下，凭借帕特里克·安德森在补时阶段最后时刻的禁区内间接任意球逼平汉堡队，再次夺得德甲冠军。沙尔克04队的球迷也在这一时刻经历了从大喜到大悲的过程。同时铸就了沙尔克04队在德甲著名的“4分钟冠军”。在这一年的欧洲冠军联赛赛场上，拜仁慕尼黑队完成了一系列复仇战。先是在四分之一决赛上分别以客场1比0、主场2比1的比分淘汰了曼彻斯特联队。半决赛两回合分别以客场1比0和主场2比1的相同比分战胜了皇家马德里。凭借连续双杀当时欧洲最强两队的骄人战绩，拜仁慕尼黑队再度昂首杀入欧洲冠军杯决赛。2001年5月23日，拜仁慕尼黑队圣西罗球场迎来了决赛对手瓦伦西亚队。卡恩成了当晚的英雄，在120分钟内两队战成1比1平。在随后的点球大战中，卡恩扑出了3个点球，帮助球队第四次举起了欧洲冠军杯。在随后的2001－2002赛季中，拜仁慕尼黑队仅取得了一项冠军。在联赛冠军的争夺战中，球队排在多特蒙德和勒沃库森队后。在德国杯半决赛上，拜仁慕尼黑队又以0比2输给了沙尔克04队。欧洲赛场上，他们又被老对手皇家马德里队挡在了四强之外。唯一安慰球迷的就是丰田杯赛场上战胜了博卡青年队，库福尔的进球让球队本赛季不至于一无所获。 2002－2003年的德甲联赛中，拜仁慕尼黑队以16分的绝对优势压倒斯图加特队，毫无悬念的夺得冠军。在德国杯决赛上，凭借巴拉克的两个进球，球队3比1战胜凯泽斯劳滕队，第四次夺得双冠王。作为埃芬博格接班人的巴拉克被评为年度德国足球先生。这一年唯一的遗憾就是冠军杯小组赛即遭淘汰。但任何事情都有两面性，帮助拉科鲁尼亚队战胜拜仁慕尼黑的荷兰射手马凯，在这一年结束后披上了红色战袍，并创造了球队当时的转会费纪录：1875万欧元。 2004—2005赛季，拜仁慕尼黑的主教练换为了带领斯图加特青年军的马加特。率队获得了联赛及杯赛双冠王并成功卫冕。但球队在欧冠赛场上始终得不到突破，特别是在06年客场1-4惨败AC米兰队，在01夺冠后连续6年未能闯进欧冠半决赛。值得一提的是，球队在2005年起用了新球场，安联球场。它是世界上最好的球场之一。 2006—2007赛季，遭遇了少有的低谷。赛季前，头号球星巴拉克远走英伦切尔西。球队在赛程前半段还能苦苦支撑，在冬歇期结束后，俱乐部高层换上了功勋老帅希斯菲尔德。在之后的欧冠赛场上，凭借着马凯在安联球场10秒欧冠历史最快进球，拜仁慕尼黑淘汰老冤家皇家马德里队，但在八分之一决赛上，面对从“电话门”假球丑闻中勉强脱身的AC米兰队，在客场2比2的大好形势下主场奇迹般的0比2告负。但塞翁失马，焉知非福。10年来首次失去欧冠参赛资格的耻辱深深刺痛了球队管理层。在接下来的2007－2008赛季开始前，拜仁慕尼黑队分别以2500万欧元引进法国新星里贝里、1100万欧元买来意大利正印中锋托尼、1500万欧元签下德国头牌前锋克洛泽等强援，在创造了俱乐部单笔引进纪录的同时也创造了一个赛季花费7000多万欧元的德甲纪录。该赛季，在功勋名帅希斯菲尔德的出色指挥下，拜仁还创造全赛季34轮仅失15球的德甲新纪录，以及从第1轮直到最后第34轮整个赛季位列榜首的不朽神话。 2008－2009赛季，拜仁慕尼黑队送走了功勋老帅希斯菲尔德，功勋门神、精神领袖卡恩，以及因伤被迫提前退役世界顶级右后卫萨尼奥尔。同时请来了在2006年率领德国国家队于本土世界杯获得第3名的“金色轰炸机”克林斯曼担任新的主帅，并于这个赛季赛季初翻修了训练基地。但由于克林斯曼率队战绩拙劣，相继在欧洲冠军联赛被巴塞罗那队以4比0、在德甲被沃尔夫斯堡以5比1大比分羞辱。球员对主帅丧失信心，克林斯曼因而黯然下课。拜仁慕尼黑请来老帅海因克斯救火，老帅在最后5轮的联赛里以4胜1平的不败战绩力挽狂澜，保住了球队下赛季欧洲冠军杯的席位。但终因上任前球队失分太多，未能再度夺冠。赛季结束后，海因克斯离开了拜仁慕尼黑队。 2009－2010赛季，拜仁慕尼黑队请来荷兰籍名帅范加尔，同时在转会市场注入7470万欧元，引入了戈麦斯，罗本，季末什丘克等大牌球星，创下新的赛季转会消费记录，而在欧冠小组赛中，在小组赛只剩两轮还落后同组第二名意甲豪门尤文图斯的情况下上演绝地翻盘，在最后一场小组赛中于都灵大开杀戒，以4：1的比分客场拿下尤文，打出了被称为奇迹的比赛，晋级欧冠淘汰赛。并在赛季中段多线作战创下13连胜的骄人战绩。在欧冠淘汰赛中先后击败佛罗伦萨，曼联，里昂，晋级决赛，并于5月2日，提前一轮登顶德甲冠军。北京时间5月16日，拜仁在柏林以4:0击败卫冕冠军不莱梅，取得德国杯的冠军。5月23日，拜仁在伯纳乌球场的决赛中0：2不敌国米，获得亚军。安联球场

Felix Magath（2006－2007赛季）

25穆勒 25德国前锋

2.凯恩：英格兰国家队队长，强大的进球能力和领袖气质使他成为球队进攻端的关键人物。

代表拜仁联赛出战144场，进2球。

27阿拉巴奥地利中场 1992-06-24 171 75

1曼努埃尔·诺伊尔德国门将 1986.03.27 193 90

1972-1973赛季

2014年，随德国国家队获得世界杯冠军，并获得世界杯金手套奖。2014年8月，诺伊尔成为继卡恩之后第一位也是唯一一位进入欧洲足球先生评选前三的门将，最终诺伊尔获得欧洲足球先生第二名。

生于1923年11月24日，卒于1998年6月28日，从1963年7月1日到1968年6月30日执教拜仁5个完整赛季，获得2次德国足协杯冠军、1次欧洲优胜者杯冠军等共3个正式比赛的冠军头衔，他的伟大之处在于为拜仁带来了第一个欧洲赛事的冠军，更重要的是带来了伟大的贝肯鲍尔和伟大的盖德•穆勒！拜仁也于1965年加入德国甲级联赛。

转出：奥利弗.卡恩（门将，退役），瓦莱里安·伊斯梅尔（后卫，20万欧元，汉诺威96）

30路易斯·古斯塔沃巴西中场/后卫 1987.07.23 187 80

从1950年8月1日到1950年12月1日执教拜仁4个月。

根据拜仁慕尼黑最初的球队章程，球队的球衣颜色应该是蓝色和白色，但是俱乐部在1905年加入MSC之前，一直身着的是白色的上衣和黑色的短裤。MSC要求，足球运动员应该身着红色短裤进行比赛，所以在后来的大部分时间当中，拜仁的球衣主色调变为了红色和白色，有时也会出现蓝色。1969-70赛季，拜仁主场球衣是蓝白间条衫，并且短裤和袜子的颜色同样是蓝色。1995年，拜仁的球衣也有相似的设计。但从1999年开始，拜仁回归了最初的颜色。长年以来，拜仁的客场球衣没有固定的颜色，曾经使用过的颜色包括了白色、黑色、蓝色以及黄绿色等。此外，拜仁还拥有一套第三球衣。

6.帕利尼亚：中场球员，他的身体素质和对抗能力为球队的中场提供了坚实的保护。